Viena iš galimų daugelio juostų PGR priežasčių yra nespecifinis pradmenų atkaitinimas. ... Per daug PGR ciklų (daugiau nei 30) taip pat gali sukelti kelias juostas dėl padidėjusios klaidų tikimybės su kiekvienu ciklu. DNR užterštumas yra dar vienas galimas veiksnys.
- Kodėl gelio elektroforezėje yra kelios juostos??
- Kaip pašalinti kelių juostų PGR triktis?
- Kas yra PGR juostos??
- Kodėl RAPD yra kelios juostos??
Kodėl gelio elektroforezėje yra kelios juostos??
Gelio matrica veikia kaip sietas: mažesnės DNR molekulės migruoja greičiau nei didesnės, todėl įvairaus dydžio DNR molekulės elektroforezės metu išsiskiria į skirtingas juostas.
Kaip pašalinti kelių juostų PGR triktis?
Populiarūs atsakymai (1)
- atlikite reakciją naudodami neigiamą kontrolę (be šablono). ...
- Padidinkite atkaitinimo temperatūrą. ...
- Iš naujo suprojektuokite gruntus ir padarykite 3 ′ ilgesnius. ...
- Jei nespecifiniai produktai yra trumpesni už jūsų tikslą, padidinkite atkaitinimo laiką. ...
- Naudokite mažiau DNR šablono.
- Pabandykite prisiliesti prie PCR.
Kas yra PGR juostos??
Silpna viršutinė juosta (298 bp) identifikuoja PGR produktą, amplifikuotą iš vieno genomo taikinio. Ryškesnė apatinė juosta (238 bp) identifikuoja daugialypį PGR produktą su 10 pakartojimų kopijų tame pačiame genome. Abiejuose šiuose tiksliniuose regionuose yra 100% identiškų pradmenų surišimo vietų.
Kodėl RAPD yra kelios juostos??
Kadangi RAPD generuojami atsitiktinai atkaitinant, naudojant 10 nukleotidų pradmenį, galima tikėtis, kad po kiekvieno pradmens bus daugybė fragmentų. ... Priklausomai nuo to, ką lyginate (daugiau ar mažiau genetiškai susiję), polimorfinių juostų skaičius skirsis.