Ncbi sprogimas

1. Kam vartojamas NCBI BLAST??
2. Ar NCBI BLAST yra programinė įranga?
3. Kaip rasti BLAST?
4. Kas yra „NCBI GenBank“?

Kam vartojamas NCBI BLAST??

„Basic Local Alignment Search Tool“ (BLAST) randa regionų, kuriuose yra panašumų tarp baltymų ar nukleotidų sekų. Programa palygina nukleotidų ar baltymų sekas su seka duomenų bazėje ir apskaičiuoja atitikties statistinę reikšmę.

Ar NCBI BLAST yra programinė įranga?

1990 m. Nacionalinio biotechnologijų informacijos centro (NCBI) tyrėjai išleido naują programinės įrangos paketą, skirtą greitam DNR ir baltymų sekų palyginimui [15].

Kaip rasti BLAST?

BLAST sekos panašumo paieška

1. Pasirinkite įrankių juostos skirtuką „Blast“ puslapio viršuje, kad atliktumėte sekos panašumo paiešką su programa „Blast“.
2. Formos lauke įveskite baltymų arba nukleotidų seką arba UniProt identifikatorių (37 pav.).
3. Spustelėkite mygtuką „Vykdyti sprogimą“.

Kas yra „NCBI GenBank“?

„GenBank®“ yra išsami duomenų bazė, kurioje yra viešai prieinamos daugiau nei 300 000 organizmų, pavadintų genties lygiu ar žemesne, nukleotidų sekos, pirmiausia gautos iš atskirų laboratorijų ir partijos pateiktų didelio masto sekos nustatymo projektų, įskaitant viso genomo šautuvą ( ...